Devido a uma série de motivos, a família de sistema operacional Windows é a mais visada pelos projetistas de vírus. Alguns dos motivos mais citados estão listados abaixo:
- amplamente utilizado
- alto índice de usuários leigos
- forma como foi projetada inicialmente: sem sistema de permissões e monousuário (argumento questionável e por muitos considerado falso)
- relativa demora na entrega de correções (argumento questionável e por muitos considerado falso)
- dependente de software de terceiros para eficaz segurança
Muitas pessoas do movimento OpenSource acreditam que os principais problemas de segurança do Windows estão associados ao modelo de desenvolvimento desse software: os usuários não tem acesso ao código fonte, e consequentemente, não podem visualizar brechas e apontar correções, gerando uma demora na entrega de correções e maior número de brechas não corrigidas. Já os defensores do Windows acreditam que por o código do mesmo ser revisto justamente por pessoas plenamente capacitadas para tal e por isso, ao contrário do movimento OpenSource, que não pode garantir a profissionalização de seus programadores, o modelo proprietário é melhor segundo os mesmos, mais confiável e com menor índice de falhas.
O índice de vírus no sistema operacional GNU/Linux é muito mais baixo que no Windows, mas falhas de segurança que podem levar o sistema a tornar-se inseguro são descobertas com mais frequência se comparadas ao Windows. Por isso, é importante, que independente do sistema operacional que utilize, você o mantenha sempre atualizado.